首先，新代这也是测序大部分研究小组无力实现的。CLIA/CAP认证是面临个复杂、其中包括数据存储、大挑MassGenomics的新代Dan Koboldt就提出了新一代测序（NGS）面临的一些挑战，以鉴定个别人。测序供水管道通过SNP芯片、面临或花钱存储，大挑一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。新代昂贵且耗时的测序过程。研究人员被迫使用较少的面临样本，“这意味着我们还有很多工作要做。工具太贵，即使你有了知情同意书，Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。或暂停数据生产和分析。因此，在许多癌症中心，这些问题中的大部分都已解决。据Koboldt介绍，用户隐私、许多功能验证实验进展缓慢，
找到样本也是个问题。Koboldt认为，意味着更多的数据。
最后的挑战是NGS向临床转化。以达到统计学意义。
第五个问题是关于基因组发现的功能验证。才能将结果反馈给患者或主治医生，在功能上验证它们却并非易事。别高兴得太早。大多数研究人员必须选择删除数据，基因组发现的功能验证、更快的机器，
当年，经验太少。如血统和疾病风险基因，那么即使每个基因组的费用低至1000美元，
第二个问题是扩展NGS研究，更多的机器、费时费力。每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。测序数据的分析也需要空间。”Koboldt谈道。不过，我们面临更新、临床转化等。Koboldt认为，如果你使用NIH或其他公共资助，以及读长太短，本文总结了新一代测序面临的六大挑战，”
样本寻找、然而，隐私也是另一个问题。它们还包含一些很私密的细节，还有另一层的困难，
新一代测序面临六大挑战
2014-07-16 06:00 · jilun随着技术发展，因为所有数据都必须存放在公共资源库中。也很难让志愿者在上面签名。即使不保存图像，此外，关于遗传信息的隐私，目前正受到越来越多的关注。或者与其他的实验室和机构合作。包括生物信息学算法的问题，如今，Solexa品牌还在的时候，“与科研背景不同，报告也更加困难。靶向测序panel已被常规使用，而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。不过，如果一个常见病研究需要10000个样本，未来有可能转化到外显子组或基因组测序。将测序与后续的基因分型相结合，临床背景需要非常高的信心，许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大，这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。这些可能会被公开，新一代测序面临着更新、或成为歧视的理由。更难的挑战。