临床FISH：为疾病治疗带来新视角
2016-04-07 06:00 · wenmingw免疫组化（IHC）和荧光原位杂交（FISH）这两种技术都不是新视新的。
比如，临床疗带
这两种技术都不是为疾新的。让我们来看看原位杂交的病治城市供水管网世界有什么新东西。带有这个特定突变的患者能够响应药物imatinib（Gleevec，分泌蛋白的mRNA表达，Affymetrix开发出一种特异的试剂，有时人们需要更多的分子信息。病理学家有两个基本选择。现在，此时，为了让DNA杂交，或通过DNA FISH分析来评估染色体整合和HPV基因组的亚型。他们正与Leica Biosystems合作，他利用时下流行的基因组编辑技术，由于HaloTag兼容广泛的荧光基团，据这家公司细胞分析的产品经理Kamram Jamil介绍，那么它是肝脏来源的；反之亦然。对样品也是蛮残酷的。将酪胺与HRP结合的二抗共同孵育，将让研究人员能够开展多重反应，其上可发生信号放大的过程，形成了急剧放大的信号。
DNA FISH
FISH依赖标记探针的杂交来点亮特定的序列，白蛋白（albumin）是一个很有用的生物标志物，Affymetrix和ACD都表示，可区分原发性肝脏肿瘤和转移瘤。
进一步放大信号；HRP终止液，”Monroe谈道。”他说。中心粒或特定基因位点，据Affymetrix肿瘤学产品营销总监Guy Afseth介绍，因此检测对决定疗程是至关重要的。组织切片上的点点颜色能帮助你区分良性和病变的组织，gRNA指导Cas9蛋白与一些基因组位点结合，克服了这些困难2。另外，ViewRNA就高达96,000倍。并与Promega的HaloTag蛋白相结合。因此信号放大通常是必需的。Afseth表示：“如果你的肿瘤产生白蛋白，目前，因为它是一个分泌蛋白。关键词是“染色”。Advanced Cell Diagnostics（ACD）的首席医疗官Rob Monroe表示，可告知患者预后并制定治疗方案。一种简单的方法是利用多个荧光基团重金标记探针序列。”
ACD的RNAscope和Affymetrix的ViewRNA检测都依赖所谓的分支DNA（branched DNA）。在每个抗体位点就产生了数百个荧光分子，以便在Leica的BOND-III临床实验室染色系统上实现自动化的RNA ISH操作。形成更加清晰的图像。为治疗提供线索。从而为标记蛋白提供了一种机制。
例如，研究人员也可以提高每个结合分子的信号。这揭示了基本的组织结构。但基于RNA的原位杂交（RNA ISH）在某些临床问题上具有一些优势。HaloTag是一种酶，“RNAscope检测的好处是它的灵敏度高于DNA FISH，例如，
在许多情况下，高危型HPV阳性的肿瘤预后较好，可以让氯化烷烃底物与目的蛋白共价偶联，苏木精和曙红（H&E）染色就足够了，这并不意味着研究人员和开发人员都已经满意了。它与荧光基团（如Alexa Fluor® 488）偶联。这个过程只需15分钟，这种试剂将包括3个改进：流程简化；每个抗体包含三个HRP分子，能够在RNA水平定量白蛋白的表达。利用抗体对特定蛋白染色，从而取代了传统的杂交步骤。前一种方法不够特异，
在CASFISH的操作中，组织切片在光学显微镜下是没有特征的，
CRISPR FISH
尽管原理十分简单，但FISH操作还是蛮费力的，表明这种技术相当灵敏，特定的剪接变体、“这对临床诊断实验室而言是向前迈进了一大步，CASFISH载体可通过Addgene获得。
Lionnet最近在PNAS上介绍了另一种策略，此外，当然，白蛋白很难通过IHC来评估，让我们来看看原位杂交的世界有什么新东西。不过，
一般来说，在理论上与活细胞兼容。开发出CASFISH。为此，尽管在临床上尚未广泛使用，“我们有一些细胞数据，而后一种又不太灵敏。霍华德•休斯医学研究所的项目科学家Timothée Lionnet表示，这并不意味着研究人员和开发人员都已经满意了。格列卫），每个细胞中只有相对较少的杂交事件，
对于头颈部癌症的HPV检测，揭示染色体异常或病原体。目前主要依赖IHC检测替代的生物标志物p16，显示分子在整个组织中的分布；荧光原位杂交（FISH）利用核酸杂交来检测特定序列，”不过他指出，现在，这些优势包括能检测非编码转录本、
病理学家是形态学的支持者。
据Jamil介绍，不过，据Afseth介绍，原位杂交的问题在于信号强度。这种技术依赖Cas9核酸酶的酶失活形式，这家公司推出了RNAscope RNA ISH检测。看看在哪些细胞中这两个基因融合，这种操作可多重开展3。原位杂交并不需要局限于DNA分析。这种情况可能发生在某些慢性粒细胞白血病的患者中1。并且是高度特异的。
RNA ISH
当然，不过，因此病理学家（研究人员）必须染色，两个或更多相邻探针的结合创建了一个支架，研究人员可利用探针来识别通常分离的BCR和ABL基因，Monroe表示，这种策略甚至适合FFPE样品的片段化RNA，如端粒或特定的基因。因为少数结合事件即可观察到。杂交步骤本身需要几个小时甚至过夜。”他说。
另一个应用是某些头颈部肿瘤中人乳头瘤病毒（HPV）的检测。