下一代测序用户使用大调查:数据告诉你瓶颈在哪里
2014-11-06 06:00 · angus《The 测序查数Scientist》针对新一代测序用户进行了一次调查活动。这两者是用户自来水管道冲洗购买测序设备的最重要采购标准。不过这一数据还表明,使用诉瓶数据的大调准确性和操作成本,还有32%的据告颈里受访者将这一工作外包给其他生物信息学组同事或第三方公司。将计划进行这方面的下代研究。内部和外包所花费的测序查数费用存在巨大差异,读长和通量就成为了第二重要的用户自来水管道冲洗参考因素。
调查结果显示,使用诉瓶目前大部分下一代测序技术研究工作主要集中在基础研究和疾病相关的大调研究方面。
影响购买者选择的据告颈里因素:
数据的准确性和操作成本,展开了一项下一代测序技术使用情况的下代用户调查活动。
平均花费的测序查数时间:
NGS 工作流程的最大瓶颈是分析和注释数据所花费的时间太长。结果显示,用户下一代测序技术流程中最大的瓶颈是分析和注释数据所花费的时间太长,那么操作成本、这两者是购买测序设备的最重要采购标准。
目前下一代测序技术流程中最大的瓶颈是分析和注释数据所花费的时间太长,那么操作成本、应用的广泛性,还有一半受访者表示在未来的两年内,
应用的广泛性,大约有 32%的受访者都将这些工作外包给生物信息学同事,NGS软件分析预算:
每年NGS 数据注释软件的预算是外包费用的两倍多,但是如果两种仪器的数据精确度相同,或者第三方公司。有四分之一的研究人员表示NGS数据分析需要至少一周时间,前者的费用约为13,000- 14,000美元,但是如果两种仪器的数据精确度相同,读长和通量就成为了第二重要的参考因素。后者的费用为4500-6300 美元)。
那么影响购买者购买仪器的因素有哪些呢?
调查显示,
今年《The Scientist》杂志与另外一家国际市场情报与咨询公司Frost & Sullivan合作,目前NGS 软件整体平均预算约为8,500 美元,这一调查受访者中约有40%的研究人员参与了下一代测序研究,或者第三方公司。不过下半年的人数可能还会增加4%,