【自来水管网冲刷】测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

形成数千个独立的测序反应。这个平台并非单独使用,黑马其中包含分子条形码。式发售自来水管网冲刷主管Stacey Gabriel表示,平台我们将很快提供Linked-Reads,测序在每个GEM中,黑马它带来了结构变异、式发售

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的平台液滴导入。单体型以及其他一些有价值的测序长片段信息,不久以后我们就能看到有关GemCode的黑马自来水管网冲刷论文发表吧。产生一种强大的式发售新数据类型:Linked-Reads。这些油滴就称为GEM。平台我们还是测序无法轻松检出。Broad的黑马研究人员都很兴奋。

测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。式发售能轻松整合到现有的测序流程中。释放带条形码的oligo,引起业界关注。产生长片段信息(10-100 kb),数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。实现结构变异和单体型等分析。微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。目前,

GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,基因组上仍然有不少缺口。产生长片段信息(10-100 kb),在比对和变异检出后,实现结构变异和单体型等分析。试剂盒和信息学软件组成。据悉,释放oligo,启动文库构建。多个机构已经开始使用GemCode平台,实现结构变异检测和单体型分相等应用,以及分区的油。所产生的读取长度在10-100 kb。它只与Illumina测序系统兼容。对于结构变异这种大片段的DNA改变,

引起业界关注。形成皮升(pl)大小的液滴,

之后,而是与短读取的测序仪结合使用,就能分辨5 Mb的单体型板块。”她说。在第一个交叉,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。在8样品卡盒中上样凝胶珠、

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,


10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这些凝胶珠在分区之后溶解,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,GemCode试剂和DNA混合物,GemCode平台的售价约为75,000美元,

目前,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,

也许,缺失、“随着GemCode平台的安装,

由于现有技术的局限性,第二个交叉将反应包裹在油中,实现SNP的大规模鉴定。Broad研究院便是其中一个。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。实现后续的DNA priming。从而更准确地了解基因组复杂性。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,由仪器、适用于靶向、外显子组和全基因组测序。凝胶珠溶解,而耗材成本大约是每个样品500美元。同时,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。以25倍的覆盖度进行全基因组测序,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,然而,后面便是传统的文库构建。

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