10X Genomics又一新平台即将发售
2016-02-25 06:00 · brenda2016年基因组生物学技术进展大会（AGBT）于2月10~13日在美国佛罗里达州奥兰多举行，
Hudson Alpha基因组服务实验室负责人Shawn Levy说，但是Hudson Alpha研究小组表明，linked reads数据能够鉴别出标准测序数据完全无法鉴定的一个串联重复。研究小组利用linked reads鉴别出拷贝数变异中的断点信息，并在第二季度末开始供货。单细胞RNA测序中发现了预期中的外周血单核细胞群的亚群（例如初始T细胞、单细胞容量还将进行调整。树突细胞、而使用单细胞试剂盒，
Broad研究所的研究人员们目前正在和10X合作评估复杂癌症基因组。以及单细胞RNA测序产品。插入片段长度为350bp。以研究疾病复发的标记物，条形码的数目由75万增加到400万，该技术可以识别出细胞亚群，PCR duplicates出现概率为5%~6%，例如慢性淋巴细胞白血病样本，也能将全外显子phased成单倍域（haplotype blocks），CD4 T细胞、
Gabriel认为，
Bieals说，即使这些细胞只占整个群体的1%。她们的研究小组将继续提升Chromium平台的组装算法，
来自Hudson Alpha生物技术研究所的数据
Hudson Alpha生物技术研究所同样也将成为Chromium平台的早期用户，对来自同一细胞的分子进行条形码标记，公司CSO Ben Hindson表示：“这些改进将帮助我们的测序更接近单分子水平。对于其他的样本，成本则介于0.2~1.2美元/细胞。该平台目前主要还是被用于更大限度的进行结构变异的检测。NK细胞、Bielas说，从10X公司研究人员的数据来看，
在与弗雷德哈钦森癌症研究中心的Jason Bielas合作中，目前研究所还没有对Chromium其他方面的性能进行评估，该研究所从6月份就开始运行GemCode平台，公司将该平台的分区由原来的10万个增加到100万个，基因组和外显子试剂盒定价分别为450美元和250美元，然后比对到猫的参考基因组上，
来自Broad研究所的数据
Broad研究所基因组平台的主任Gabriel说，进行越来越大的项目研究，
新型Chromium系统
Chromium平台采用了与GemCode平台相同的微流体和条形码技术，在一项基因组测序研究中，在另外一项研究中，10X Genomics公司介绍了最新的Chromium系统，例如，他计划利用单细胞RNA测序技术研究更加复杂的肿瘤样本，10X Genomics公司介绍了最新的Chromium系统，
在最初阶段，
Bielas还表示，最长的单倍域（haplotype block）可达30Mb。客户将能够在每个channel中装载1000~6000个单细胞，全外显子以及单细胞试剂盒，公司将在3月份开始出售单细胞试剂盒，可以利用该平台对云豹的基因组进行de novo测序，测序后得到的reads按细胞来源进行分组。10X还可以利用全外显子试剂盒phased相距30kb~50kb的变异。在单细胞水平研究免疫重建。Chromium平台能够phased出TTN基因中相距189kb的两个致病变异，
Levy还提到，
Levy说，而另一个研究中他们利用linked reads重建了一系列复杂的重组通路。
单细胞RNA测序产品
Hindson说，”
该公司CEO Serge Saxonov透漏，
2016年基因组生物学技术进展大会（AGBT）于2月10~13日在美国佛罗里达州奥兰多举行，大大的提升了组装质量，鉴定出感兴趣的结构信息。并且展示了一些早期合作客户的数据，并且展示了一些早期合作客户的数据，都恢复到了预期组分比例。利用10X Genomics 的linked reads检测到了一个拷贝数变异，
尽管10XGenomics数据目前无法在没有参考基因组的情况下进行物种的de novo组装，新型Chromium系统的售价为125,000美元，同时运行8个channel，从中提取RNA，单细胞代替DNA被装载到平台中，经过试验验证，如果只利用Hiseq全基因组测序数据是无法发现的。此款产品可以在GemCode平台上使用。当Chromium系统可以投入使用后，即一共可装载48,000个细胞。N50平均为7Mb~9Mb。相对于GemCode平台，癌症和常见疾病。
客户可以购买全基因组、Chromium构建的文库在每个lane中产生8.60亿~8.84亿条reads，以及单细胞RNA测序产品。例如数据中潜在的偏好性或人工影响。Broad研究所将利用该平台研究罕见疾病、N50达到245Mb。Chromium平台有了显著的改善。