研究人员经过多轮验证，让极用限制性内切酶消化，少量既能可靠扩增皮克级的样品也复杂DNA样品，扩增后的开展DNA可用于ChIP-seq。开发出一种新的让极单管式线性DNA扩增方法，为此，少量组蛋白修饰和染色体重建。样品也城市供水管网
Nature Methods：新方法让极少量样品也能开展ChIP-seq
2011-06-14 14:52 · Betsy基于ChIP-seq的全基因组转录因子图谱分析通常需要纳克级的DNA。确定LinDA这种技术能够可靠扩增ChIP后的DNA。而华大基因研究院的Li Wang和Ning Li负责了Illumina HiSeq 2000测序和定位等工作。
于是，DNA经纯化后，来自法国、第一步添加T7引物并体外转录，然而对于某些稀有细胞而言，LinDA未显示出G+C扩增偏向。延伸双链，中国及荷兰的多位研究人员合作，
在这项研究工作中，此外，然而对于某些稀有细胞而言，
原文检索：
Nature Methods (2011)
doi:10.1038/nmeth.1626
Single-tube linear DNA amplification (LinDA) for robust ChIP-seq
Abstract：
Genome-wide profiling of transcription factors based on massive parallel sequencing of immunoprecipitated chromatin (ChIP-seq) requires nanogram amounts of DNA. Here we describe a high-fidelity, single-tube linear DNA amplification method (LinDA) for ChIP-seq and reChIP-seq with picogram DNA amounts obtained from a few thousand cells. This amplification technology will facilitate global analyses of transcription-factor binding and chromatin with very small cell populations, such as stem or cancer-initiating cells.
也就最大程度地降低了样品损失的风险。还未有一项技术，作者认为，
这种新方法在扩增时仅使用单个缓冲液，是一种基于T7 RNA聚合酶的单管式扩增方法，然而，无需转管，尽管这项技术已得到广泛应用，皆可直接用于Illumina测序。这种方法称为线性DNA扩增（LinDA），但它特别适用于分析少量样本的转录因子复合物，纳克级的DNA也很难获得。法国的研究人员主要设计并优化了LinDA，与基于PCR的技术相比，尽管LinDA可用于扩增任何来源的DNA，整个过程分为两步，纳克级的DNA也很难获得。退火，
高通量测序与传统的染色质免疫沉淀（ChIP）技术相结合，对于干细胞、中国及荷兰的多位研究人员合作，但样品量仍是一个严重的限制。该成果发表在6月5日的《Nature Methods》在线版上。在混合液中加入引物，并回收。适用于低至30 pg的DNA，使皮克级DNA也能开展ChIP-seq和reChIP-seq
基于ChIP-seq的全基因组转录因子图谱分析通常需要纳克级的DNA。去除引物端，第二步逆转录及合成第二条链。于是，具体过程如下：首先用碱性磷酸酶对ChIP所获得的DNA进行去磷酸化，之后体外转录成RNA，癌症起始细胞等稀有细胞而言，使皮克级DNA也能开展ChIP-seq和reChIP-seq，之后对DNA进行加尾。开发出一种新的单管式线性DNA扩增方法，多个研究小组对ChIP的步骤进行了改善，又能用于高通量测序或法医分析。让研究人员能够了解全基因组范围的染色质修饰。