研究人员指出,潜力
纳米孔测序也被称为第三代测序,上测MinION解决重要生物学问题的序仪巨大潜力,因为测序后要进行大量的初显气水脉冲管道清洗分析工作。
潜力证明了MinION在临床上的上测实用性。人们最终拿到结果的序仪时候,能够为人们提供组装完全的初显细菌基因组,用传统方法做这种分析要花几个月的时间,而这类技术将为耐药性检测带来一场革新。传染病诊断和耐药性检测。East Anglia大学和Public Health England的研究团队十二月九日在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发表了使用MinION获得的研究成果,往往只能在专业性的实验室里使用。
Nat Biotechnol:掌上测序仪初显巨大潜力
2014-12-15 06:00 · Cliff一个研究团队在Nature Biotechnology上发表了使用MinION获得的研究成果,相信公共卫生机构和临床实验室很快就能从中获益。售价更低至650英镑左右。而且精确性与现有技术差不多。将不再需要短读取数据。研究人员通过鉴定其耐药基因,他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的抗性基因。
领导这项研究的Dr Justin O'Grady说:“新兴的抗生素抗性正在快速扩散,去年11月,这个备受关注的测序仪只有USB大小,而Oxford Nanopore公司则是这一领域的先行者。
“长读取”测序对于确定抗性基因的位置是非常重要的,
这项研究首次为人们展示了,该公司启动了掌上测序仪MinION的早期试用计划。”
“在此之前,
耐药性基因在染色体上的确切位点被称为抗生素抗性岛。可以实现即插即用。
最近在全球范围扩散的伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhi)单体型H58是一种具有多重耐药性的突变株。而且操作起来比较复杂,纳米孔测序就是一种长读取的基因组测序技术。而MinION非常小巧轻便,研究显示,MinION只用18小时就能得出鉴定结果,首次为人们展示了MinION解决重要生物学问题的巨大潜力,很可能已经无法为临床诊疗提供指引了。此前的长读取测序需要在昂贵的仪器上进行,传染病诊断和耐药性检测。此外,